Cellosaurus PE/CA-PJ15 (CVCL_2678)
Cell line name | PE/CA-PJ15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | PE-CA-PJ15; PE/CA PJ15; PE/CA-PJ-15; PE_CA-PJ15; PE CA PJ15; PECAPJ15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: PE/CA-PJ15 (RRID:CVCL_2678) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Tongue squamous cell carcinoma (NCIt: C4648) Squamous cell carcinoma of the oral tongue (ORDO: Orphanet_457252) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 45Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9876219 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections | ECACC; 96121230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | Cell_Model_Passport; SIDM00473
Cosmic-CLP; 1240207 DepMap; ACH-000619 LINCS_HMS; 50039 LINCS_LDP; LCL-1212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473150
BioSample; SAMN10988005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1240207
PharmacoDB; PE_CAPJ15_1256_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54946882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006733 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827436 GEO; GSM887508 GEO; GSM888590 GEO; GSM1374826 GEO; GSM1374827 GEO; GSM1670346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1339923
Cosmic; 1995614 IARC_TP53; 28304 LiGeA; CCLE_253 Progenetix; CVCL_2678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 21-Mar-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 30 |