Cellosaurus OE21 (CVCL_2661)
Cell line name | OE21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OE-21; JROECL 21; JROECL21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OE21 (RRID:CVCL_2661) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Esophagus; UBERON=UBERON_0001043. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal squamous cell carcinoma (NCIt: C4024) Squamous cell carcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99977) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 74Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1298359; ECACC=96062201; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9010035; DOI=10.1038/bjc.1997.42; PMCID=PMC2063267 PubMed=16364037; DOI=10.1111/j.1442-2050.2006.00530.x PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26512696; DOI=10.3390/cancers7040881; PMCID=PMC4695881 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ECACC; 96062201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008239
CLDB; cl5089 cancercelllines; CVCL_2661 Cell_Model_Passport; SIDM00478 Cosmic-CLP; 1298359 DepMap; ACH-000544 IGRhCellID; OE21 LINCS_LDP; LCL-1558 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0004489 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472891
BioSample; SAMN10989579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1298359
PharmacoDB; OE21_1195_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931864 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827300 GEO; GSM888556 GEO; GSM1374796 GEO; GSM1374797 GEO; GSM1375727 GEO; GSM1375728 GEO; GSM1375729 GEO; GSM1375730 GEO; GSM1375739 GEO; GSM1375740 GEO; GSM1375741 GEO; GSM1375742 GEO; GSM1375751 GEO; GSM1375752 GEO; GSM1375753 GEO; GSM1375754 GEO; GSM1670303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1339912
Cosmic; 1995601 Cosmic; 2009522 LiGeA; CCLE_787 Progenetix; CVCL_2661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |