Cellosaurus BICR 78 (CVCL_2315)
Cell line name | BICR 78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | BICR-78; BICR78; Beatson Institute for Cancer Research 78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BICR 78 (RRID:CVCL_2315) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Oral cavity, alveolar ridge; UBERON=UBERON_0004103. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Alveolar ridge squamous cell carcinoma (NCIt: C170774) Squamous cell carcinoma of the oral cavity (ORDO: Orphanet_502363) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1240122; DepMap=ACH-001332; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7646764; DOI=10.1002/mc.2940130408 PubMed=9150362; DOI=10.1038/sj.onc.1201028 PubMed=10523844; DOI=10.1038/sj.onc.1202957 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CancerTools; 152849
ECACC; 04072111 - Discontinued Ximbio; 152849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009944
cancercelllines; CVCL_2315 Cell_Model_Passport; SIDM00501 Cosmic-CLP; 1240122 DepMap; ACH-001332 LINCS_LDP; LCL-1205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1240122
PharmacoDB; BICR78_100_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54796540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006543 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827457 GEO; GSM1669624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 848755
Cosmic; 1995346 Progenetix; CVCL_2315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |