Cellosaurus TT2609-C02 (CVCL_2218)
Cell line name | TT2609-C02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | TT2609-CO2; TT2609C02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: TT2609-C02 (RRID:CVCL_2218) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 21 hours (PubMed=11716037); ~60-80 hours (DSMZ=ACC-510). Karyotypic information: Near tetraploid karyotype (PubMed=11716037). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Mitochondrial genome sequenced. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Thyroid gland; UBERON=UBERON_0002046. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Thyroid gland follicular carcinoma (NCIt: C8054) Differentiated thyroid carcinoma (ORDO: Orphanet_146) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_A594 ! TT2609-A02 CVCL_A595 ! TT2609-B02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 57Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1240223; DSMZ=ACC-510; PubMed=18713817; PubMed=30737244 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11716037; DOI=10.1089/105072501753210966 PubMed=18713817; DOI=10.1210/jc.2008-1102; PMCID=PMC2582569 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23833040; DOI=10.1210/jc.2013-2383; PMCID=PMC3763971 PubMed=25675381; DOI=10.1210/jc.2014-2764; PMCID=PMC4422887 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29066502; DOI=10.1530/ERC-17-0288 PubMed=30737244; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-18-2953; PMCID=PMC6522280 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31443247; DOI=10.3390/cancers11081185; PMCID=PMC6721552 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037156
cancercelllines; CVCL_2218 Cell_Model_Passport; SIDM00418 Cosmic-CLP; 1240223 DepMap; ACH-000716 DSMZCellDive; ACC-510 LINCS_LDP; LCL-1681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473513
BioSample; SAMN10989561 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1240223
PharmacoDB; TT2609C02_1607_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54973225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887712 GEO; GSM888805 GEO; GSM1670550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1995660
Cosmic; 2054095 IARC_TP53; 28237 LiGeA; CCLE_442 Progenetix; CVCL_2218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |