Cellosaurus SET-2 (CVCL_2187)
Cell line name | SET-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Set-2; Set2; SET2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SET-2 (RRID:CVCL_2187) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Japanese. Doubling time: ~36 hours (PubMed=10637490); ~60-80 hours (DSMZ=ACC-608). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
Source: DSMZCellDive=ACC-608
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute megakaryoblastic leukemia (NCIt: C7965) Acute megakaryoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_518) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 71Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-608; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10637490; DOI=10.1038/sj.leu.2401608 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=31739141; DOI=10.1016/j.leukres.2019.106270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_2187
Cell_Model_Passport; SIDM00397 Cosmic-CLP; 1659820 DepMap; ACH-000195 DSMZCellDive; ACC-608 Lonza; 1318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0004766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473274
BioSample; SAMN10988088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523535
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523566 GDSC; 1659820 PharmacoDB; Set2_1364_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_2187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM887564 GEO; GSM888647 GEO; GSM1374868 GEO; GSM1446764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1012054
Cosmic; 1519162 Cosmic; 1633513 Cosmic; 1943610 Cosmic; 2306995 IARC_TP53; 28307 LiGeA; CCLE_845 Progenetix; CVCL_2187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |