Cellosaurus NGP (CVCL_2141)
Cell line name | NGP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Accession | CVCL_2141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NGP (RRID:CVCL_2141) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Doubling time: ~50-70 hours (DSMZ=ACC-676). Omics: Array-based CGH. Omics: Chromatin accessibility by ATAC-seq. Omics: Deep exome analysis. Omics: H3K27ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K27me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K4me3 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Lung; UBERON=UBERON_0002048. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Disease | Neuroblastoma (NCIt: C3270) Neuroblastoma (ORDO: Orphanet_635) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y6M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-001366; DSMZ=ACC-676 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=922665; DOI=10.1002/1097-0142(197711)40:5<2256::AID-CNCR2820400536>3.0.CO;2-1 DOI=10.1016/B978-0-12-008304-6.50015-4 PubMed=6888561; DOI=10.1038/305245a0 PubMed=8490657; DOI=10.1038/ng0193-62 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50006-X PubMed=9283597; DOI=10.1016/S0165-4608(96)00362-7 DOI=10.1007/0-306-46872-7_2 PubMed=11550280; DOI=10.1002/gcc.1174 PubMed=15150091; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-03-0809 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=16822308; DOI=10.1186/1471-2407-6-177; PMCID=PMC1533846 PubMed=18724359; DOI=10.1038/nature07261; PMCID=PMC2672043 PubMed=20655465; DOI=10.1016/j.cell.2010.06.004; PMCID=PMC2913027 PubMed=22213050; DOI=10.1002/ijc.27415; PMCID=PMC3757132 PubMed=23202128; DOI=10.1038/ng.2493; PMCID=PMC3557959 PubMed=24466371; DOI=10.1593/tlo.13544; PMCID=PMC3890703 PubMed=28350380; DOI=10.1038/sdata.2017.33; PMCID=PMC5369315 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037091
cancercelllines; CVCL_2141 Cell_Model_Passport; SIDM01785 DepMap; ACH-001366 DSMZCellDive; ACC-676 LINCS_HMS; 51099 LINCS_LDP; LCL-2103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54930471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | GEO; GSM453633
GEO; GSM692865 GEO; GSM2371249 GEO; GSM2394382 GEO; GSM3145726 GEO; GSM4104589 GEO; GSM4104590 GEO; GSM4105333 GEO; GSM4105334 GEO; GSM4105335 GEO; GSM4105336 GEO; GSM4105337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 717421
Cosmic; 923823 Cosmic; 930071 Cosmic; 1019937 Cosmic; 1109120 Cosmic; 1161999 Cosmic; 1167422 Cosmic; 1167988 Cosmic; 1526637 Cosmic; 2058106 Cosmic; 2393638 IARC_TP53; 23601 Progenetix; CVCL_2141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 31 |