Cellosaurus JL-1 (CVCL_2080)
Cell line name | JL-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | JL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_2080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: JL-1 (RRID:CVCL_2080) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: 47 hours (PubMed=23840376); ~70-80 hours (DSMZ=ACC-596). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lung, pleura; UBERON=UBERON_0000977. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Pleural epithelioid mesothelioma (NCIt: C45662) Pleural mesothelioma (ORDO: Orphanet_50251) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 54Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-596; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=15372243; DOI=10.1007/s00418-004-0701-1 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23840376; DOI=10.1371/journal.pone.0065903; PMCID=PMC3688685 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=33567673; DOI=10.3390/cancers13040685; PMCID=PMC7915464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_2080
Cell_Model_Passport; SIDM01696 DepMap; ACH-000645 DSMZCellDive; ACC-596 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473060
BioSample; SAMN10988459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; JL1_708_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54898973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM887185 GEO; GSM888258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | LiGeA; CCLE_059
Progenetix; CVCL_2080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |