Cellosaurus Y-79 (CVCL_1893)
Cell line name | Y-79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Y79; GM01232; GM01232E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Y-79 (RRID:CVCL_1893) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Population: Caucasian. Doubling time: 52 hours (PubMed=4135597); 47 hours (PubMed=25326674); 24-28 hours (DOI=10.5005/jp-journals-10082-02230); ~40 hours (DSMZ=ACC-246). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Anecdotal: Named Y-79 because it was the result of the 79th attempt of a group at Yale to establish a retinoblastoma cell line. Derived from site: In situ; Eye, globe; UBERON=UBERON_0010230. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: CLS=300382
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Disease | Retinoblastoma (NCIt: C7541) Retinoblastoma (ORDO: Orphanet_790) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 2Y6M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0029001/4898; ATCC=HTB-18; CLS=300382; DepMap=ACH-001295; DSMZ=ACC-246; ECACC=86093003; ICLC=HTL99029; JCRB=JCRB3020; RCB=RCB1645 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4135597; DOI=10.1093/jnci/53.2.347 PubMed=679190 PubMed=6167750; DOI=10.1093/jnci/67.2.301 PubMed=6351622; DOI=10.1016/S0002-9394(14)77822-5 DOI=10.5795/jjscc.24.451 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=3413073; DOI=10.1073/pnas.85.16.6017; PMCID=PMC281896 PubMed=2917337; DOI=10.1016/0165-4608(89)90079-4 PubMed=1679230; DOI=10.3109/13816819109023085 CLPUB00447 PubMed=7689221; DOI=10.1073/pnas.90.16.7578; PMCID=PMC47185 PubMed=7499444; DOI=10.1007/BF01213319 PubMed=18036396; DOI=10.1016/j.cancergencyto.2007.08.014 PubMed=18799932; DOI=10.1097/MPH.0b013e31816e232d PubMed=19686387; DOI=10.1111/j.1471-4159.2009.06322.x; PMCID=PMC3726384 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=21697133; DOI=10.1167/iovs.11-7479 PubMed=23498719; DOI=10.1016/S1470-2045(13)70045-7 PubMed=25326674; DOI=10.1007/s00418-014-1285-z PubMed=27050416; DOI=10.1371/journal.pone.0153011; PMCID=PMC4822873 PubMed=27115612; DOI=10.1371/journal.pone.0153323; PMCID=PMC4846005 DOI=10.3969/j.issn.1673-713X.2017.04.002 PubMed=29162051; DOI=10.1186/s12885-017-3750-2; PMCID=PMC5698942 PubMed=29192327; DOI=10.3892/or.2017.6100; PMCID=PMC5783599 DOI=10.5005/jp-journals-10082-02230 PubMed=30584916; DOI=10.1016/j.yexcr.2018.12.018 PubMed=32123578; DOI=10.1038/s41420-020-0237-8; PMCID=PMC7026052 PubMed=32143590; DOI=10.1186/s12886-020-01348-6; PMCID=PMC7060629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0029001/4898
ATCC; HTB-18 BCRC; 60422 BCRJ; 0380 CLS; 300382 Coriell; GM01232 DSMZ; ACC-246 ECACC; 86093003 IBRC; C11182 ICLC; HTL99029 JCRB; JCRB3020 JCRB; KURB2684 - Discontinued NCBI_Iran; C201 RCB; RCB0427 - Discontinued RCB; RCB1645 Ubigene; YC-B015 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009709
CLO; CLO_0030277 CLO; CLO_0051564 CLDB; cl4796 CLDB; cl4798 CLDB; cl4797 CLDB; cl4984 cancercelllines; CVCL_1893 Cell_Model_Passport; SIDM01395 DepMap; ACH-001295 DSMZCellDive; ACC-246 IGRhCellID; Y79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002920 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN00803744
BioSample; SAMN01821607 BioSample; SAMN03472733 BioSample; SAMN03473388 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308054
ChEMBL-Targets; CHEMBL613820 PubChem_Cell_line; CVCL_1893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54995129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002392 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
GEO; GSM1250686 GEO; GSM1250688 GEO; GSM1486288 GEO; GSM2043882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688120
Cosmic; 808507 Cosmic; 1071899 Cosmic; 1176623 Progenetix; CVCL_1893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |