Cellosaurus Sc-1 (CVCL_1888)
Cell line name | Sc-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SC-1; SC1; Scott; Sci-1; SCI-1; SCI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_2717 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Sc-1 (RRID:CVCL_1888) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~30 hours (DSMZ=ACC-558). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Follicular lymphoma (NCIt: C3209) Follicular lymphoma (ORDO: Orphanet_545) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 67Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1331030; DSMZ=ACC-558; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=3098690; DOI=10.1002/ijc.2910390116 PubMed=8558920 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=16960149; DOI=10.1182/blood-2006-06-026500 PubMed=17495976; DOI=10.1038/sj.leu.2404696 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=23292937; DOI=10.1073/pnas.1205299110; PMCID=PMC3557051 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=26727417; DOI=10.3109/10428194.2015.1108414 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-558
ECACC; 96090513 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037058
cancercelllines; CVCL_1888 Cell_Model_Passport; SIDM00400 Cosmic-CLP; 1331030 DepMap; ACH-002303 - Discontinued DepMap; ACH-002392 DSMZCellDive; ACC-558 LINCS_LDP; LCL-1951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472729
BioSample; SAMN03473537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523526
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523557 GDSC; 1331031 PharmacoDB; SC1_1350_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1888 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952223 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM119486 GEO; GSM179648 GEO; GSM274843 GEO; GSM827440 GEO; GSM907520 GEO; GSM1035324 GEO; GSM1374861 GEO; GSM1670415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1086345
Cosmic; 1945190 Cosmic; 2297012 Progenetix; CVCL_1888 Progenetix; CVCL_2717 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |