Cellosaurus MEC-1 (CVCL_1870)
Cell line name | MEC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MEC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: MEC-1 (RRID:CVCL_1870) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~40 hours (PubMed=10071128; DSMZ=ACC-497). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-497
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Chronic lymphocytic leukemia (NCIt: C3163) B-cell chronic lymphocytic leukemia (ORDO: Orphanet_67038) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1871 ! MEC-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 61Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DSMZ=ACC-497; PubMed=25877200; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10071128; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00154-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=20454443; DOI=10.1155/2010/904767; PMCID=PMC2861168 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23297799; DOI=10.3109/10428194.2013.764418 PubMed=25162594; DOI=10.1371/journal.pone.0106008; PMCID=PMC4146575 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037181
cancercelllines; CVCL_1870 Cell_Model_Passport; SIDM00001 DepMap; ACH-000405 DSMZCellDive; ACC-497 IGRhCellID; MEC1 LINCS_LDP; LCL-1089 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471015
BioSample; SAMN10989555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4482990
ChEMBL-Targets; CHEMBL4483257 GDSC; 1330943 PharmacoDB; MEC1_911_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54904995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM887305 GEO; GSM888381 GEO; GSM1374667 GEO; GSM1670091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1762462
IARC_TP53; 28260 LiGeA; CCLE_715 Progenetix; CVCL_1870 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |