Cellosaurus OACM5.1 C (CVCL_1842)
Cell line name | OACM5.1 C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OAC-M5.1 C; OAC-M5.1; OACM5-1; OACM5.1; OACM5_1; OACM51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OACM5.1 C (RRID:CVCL_1842) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~48 hours (DSMZ=ACC-696). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Genome sequenced. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal adenocarcinoma (NCIt: C4025) Adenocarcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99976) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 47Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1503363; DSMZ=ACC-696; ECACC=11012006; PubMed=20075370 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=11407472; DOI=10.1007/s004280000358 PubMed=20075370; DOI=10.1093/jnci/djp499; PMCID=PMC2902814 PubMed=23795680; DOI=10.1111/dote.12095 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=27594985; DOI=10.12688/f1000research.7033.1; PMCID=PMC4991527 PubMed=28504813; DOI=10.3892/or.2017.5640; PMCID=PMC5492849 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-696
ECACC; 11012006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_1842
Cell_Model_Passport; SIDM00444 Cosmic-CLP; 1503363 DepMap; ACH-001368 DSMZCellDive; ACC-696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473445 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1503363
PharmacoDB; OACM51_1176_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-3610
GEO; GSM1670290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1599344 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 32 |