Cellosaurus Karpas-1106P (CVCL_1821)
Cell line name | Karpas-1106P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Karpas-1106p; KARPAS-1106P; Karpas 1106P; KARPAS 1106P; KARPAS1106P; Karpas1106P; Karpas-1106; Karpas 1106; Karpas1106; K1106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Karpas-1106P (RRID:CVCL_1821) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~60-100 hours (ECACC=06072607). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: miRNA expression profiling. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Primary mediastinal (thymic) large B-cell lymphoma (NCIt: C9280) Primary mediastinal large B-cell lymphoma (ORDO: Orphanet_98838) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_QY35 ! Karpas-1106A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 23Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1327773; DSMZ=ACC-545; ECACC=06072607; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7949096; DOI=10.1182/blood.V84.10.3422.3422 PubMed=7849311; DOI=10.1182/blood.V85.4.893.bloodjournal854893 PubMed=9724100; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19980925)78:1<100::AID-IJC16>3.0.CO;2-F DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=16960149; DOI=10.1182/blood-2006-06-026500 PubMed=19278952; DOI=10.1182/blood-2009-01-202028; PMCID=PMC3401058 PubMed=20628145; DOI=10.1182/blood-2010-05-282780; PMCID=PMC2995356 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-545 - Discontinued
ECACC; 06072607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_1821
Cell_Model_Passport; SIDM01011 Cosmic-CLP; 1327773 DepMap; ACH-002254 DSMZCellDive; ACC-545 Lonza; 1123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL4523588
ChEMBL-Targets; CHEMBL4523591 GDSC; 1327773 PharmacoDB; KARPAS1106P_727_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54899481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM119503 GEO; GSM157143 GEO; GSM380128 GEO; GSM552445 GEO; GSM1374584 GEO; GSM1374585 GEO; GSM1669973 GEO; GSM1897961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1013890
Cosmic; 1278829 Cosmic; 1289975 Cosmic; 2276324 Cosmic; 2297035 Cosmic; 2437271 Cosmic; 2479248 Progenetix; CVCL_1821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |