Cellosaurus EFM-192A (CVCL_1812)
Cell line name | EFM-192A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | EFM192A; EFM192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EFM-192A (RRID:CVCL_1812) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: JWGray breast cancer cell line panel. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Caucasian. Doubling time: ~9 days (DSMZ=ACC-258); 80.21 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CNV analysis. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Breast carcinoma (NCIt: C4872) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1813 ! EFM-192B CVCL_1814 ! EFM-192C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1290798; DSMZ=ACC-258; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2346643/wiki/62255 https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10969801 PubMed=19582160; DOI=10.1371/journal.pone.0006146; PMCID=PMC2702084 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24176112; DOI=10.1186/gb-2013-14-10-r110; PMCID=PMC3937590 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002889
cancercelllines; CVCL_1812 Cell_Model_Passport; SIDM01002 Cosmic-CLP; 1290798 DepMap; ACH-000117 DSMZCellDive; ACC-258 LINCS_HMS; 51114 LINCS_LDP; LCL-1478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471045
BioSample; SAMN10988213 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1290798
PharmacoDB; EFM192A_322_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54832052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM274641 GEO; GSM344365 GEO; GSM344415 GEO; GSM350532 GEO; GSM847316 GEO; GSM847470 GEO; GSM843498 GEO; GSM886998 GEO; GSM888067 GEO; GSM1172950 GEO; GSM1172858 GEO; GSM1421429 GEO; GSM1669755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1309000
Cosmic; 1995391 Cosmic; 2165004 IARC_TP53; 28290 LiGeA; CCLE_198 Progenetix; CVCL_1812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |