Cellosaurus CAL-29 (CVCL_1808)
Cell line name | CAL-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CAL 29; CAL29; Centre Antoine Lacassagne-29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1808 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-29 (RRID:CVCL_1808) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: 30 hours (Note=At 18th passage) (PubMed=11720483); ~50-60 hours (DSMZ=ACC-515). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Urinary bladder; UBERON=UBERON_0001255. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Bladder carcinoma (NCIt: C4912) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 80Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1290730; DSMZ=ACC-515 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2440566 PubMed=11720483; DOI=10.1054/bjoc.2001.2105; PMCID=PMC2375255 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24367658; DOI=10.1371/journal.pone.0084411; PMCID=PMC3867501 PubMed=24035680; DOI=10.1016/j.eururo.2013.08.057 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29732388; DOI=10.3233/BLC-180167; PMCID=PMC5929350 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-515 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037157
cancercelllines; CVCL_1808 Cell_Model_Passport; SIDM00936 Cosmic-CLP; 1290730 DepMap; ACH-000142 DSMZCellDive; ACC-515 LINCS_LDP; LCL-1711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473515
BioSample; SAMN10988514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1290730
PharmacoDB; CAL29_169_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827161 GEO; GSM886908 GEO; GSM887973 GEO; GSM1669649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 1285115
Cosmic; 1995357 Cosmic; 2050440 Cosmic; 2057444 Cosmic; 2444248 Cosmic; 2685941 IARC_TP53; 28275 LiGeA; CCLE_765 Progenetix; CVCL_1808 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |