Cellosaurus ALL-SIL (CVCL_1805)
Cell line name | ALL-SIL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | ALLSIL; SIL-ALL; Sil-ALL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: ALL-SIL (RRID:CVCL_1805) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 64 hours (PubMed=17117183); ~48 hours (DSMZ=ACC-511). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=10739008; PubMed=11226526; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: AL:L-SIL; Cosmic=913404. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 17Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=1295740; DSMZ=ACC-511 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://humantallcelllines.wordpress.com/comprehensivetable/all-sil/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8127147 PubMed=8641406; DOI=10.1111/j.1600-0609.1996.tb00721.x PubMed=10071127; DOI=10.1016/S0145-2126(98)00146-5 PubMed=10739008; DOI=10.1016/S0145-2126(99)00182-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=11226526; DOI=10.1016/S0145-2126(00)00121-1 PubMed=14504097; DOI=10.1182/blood-2003-02-0418 PubMed=15361874; DOI=10.1038/ng1425 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=17117183; DOI=10.1038/sj.bjc.6603447; PMCID=PMC2360743 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-511 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037168
cancercelllines; CVCL_1805 Cell_Model_Passport; SIDM00994 Cosmic-CLP; 1295740 DepMap; ACH-000105 DSMZCellDive; ACC-511 LINCS_LDP; LCL-2059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0005360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473514
BioSample; SAMN10988449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1295740
PharmacoDB; ALLSIL_59_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54749231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669597 GEO; GSM5137707 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 721715
Cosmic; 913404 Cosmic; 933537 Cosmic; 996306 Cosmic; 998724 Cosmic; 1037687 Cosmic; 1115585 Cosmic; 1175126 Cosmic; 1224372 Cosmic; 1330498 Cosmic; 1524789 Cosmic; 1641391 Cosmic; 1664519 Cosmic; 1760517 Cosmic; 2165718 Cosmic; 2602907 LiGeA; CCLE_156 Progenetix; CVCL_1805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |