Cellosaurus SW982 (CVCL_1734)
Cell line name | SW982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-982; SW 982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW982 (RRID:CVCL_1734) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: Stated to originate from a patient with a biphasic synovial sarcoma, however does not contain the SST-SSX1/SSX2 translocation which is typical of synovial sarcoma. Derived from site: In situ; Synovium; UBERON=UBERON_0007616. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Biphasic synovial sarcoma (NCIt: C4279) Synovial sarcoma (ORDO: Orphanet_3273) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 25Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-93; CLS=300404; Cosmic-CLP=909759; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 DOI=10.1007/978-94-011-3550-4_4 PubMed=15038780; DOI=10.1290/1543-706X(2003)039<0337:PCOAHS>2.0.CO;2 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26351324; DOI=10.1158/1535-7163.MCT-15-0074; PMCID=PMC4636476 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-93
BCRC; 60535 CLS; 300404 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009206
CLO; CLO_0037072 cancercelllines; CVCL_1734 CCRID; 3101HUMTCHu209 Cell_Model_Passport; SIDM01161 Cosmic-CLP; 909759 DepMap; ACH-001274 IGRhCellID; SW982 LINCS_LDP; LCL-1880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0006386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471376
BioSample; SAMN03472764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308534
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366238 GDSC; 909759 PharmacoDB; SW982_1552_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1670519 GEO; GSM1676321 GEO; GSM1701654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 909759
Cosmic; 1933188 Cosmic; 2009545 IARC_TP53; 27585 Progenetix; CVCL_1734 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |