Cellosaurus SW626 (CVCL_1725)
Cell line name | SW626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-626; SW 626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary accession | CVCL_IW65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW626 (RRID:CVCL_1725) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Although established from a surgical specimen from a cystadenocarcinoma of the ovary in a 46 year old female Caucasian, it now seems likely that it was established from an ovarian metastasis of a colonic carcinoma (PubMed=10433623). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Misspelling: SWS-26; PubMed=20106510. Derived from site: Metastatic; Ovary; UBERON=UBERON_0000992. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 46Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-78; Cosmic-CLP=909753; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6220172 PubMed=6582512; DOI=10.1073/pnas.81.2.568; PMCID=PMC344720 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=9698466; DOI=10.1006/gyno.1998.5039 PubMed=10433623; DOI=10.1093/jnci/91.15.1327 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=20106510; DOI=10.1016/j.ygyno.2009.12.002 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=23415752; DOI=10.1016/j.molonc.2012.12.007; PMCID=PMC4106023 PubMed=25846456; DOI=10.3892/ijo.2015.2951 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-78
CCTCC; GDC0112 CLS; 305093 - Discontinued ECACC; 91091203 KCB; KCB 2013039YJ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009197
CLO; CLO_0009222 CLDB; cl4446 cancercelllines; CVCL_1725 CCRID; 4201HUM-CCTCC00112 Cell_Model_Passport; SIDM01168 Cosmic-CLP; 909753 DepMap; ACH-001399 LINCS_LDP; LCL-1529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472756
BioSample; SAMN03472876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 1030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308130
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075593 GDSC; 909753 PharmacoDB; SW626_1542_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM186459 GEO; GSM186460 GEO; GSM313714 GEO; GSM659406 GEO; GSM784571 GEO; GSM1670509 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 724882
Cosmic; 844346 Cosmic; 849608 Cosmic; 867865 Cosmic; 897437 Cosmic; 909753 Cosmic; 920358 Cosmic; 948285 Cosmic; 949229 Cosmic; 1044244 Cosmic; 1093559 Cosmic; 1113284 Cosmic; 1312194 Cosmic; 1707572 Cosmic; 2582804 Cosmic; 2674699 IARC_TP53; 27252 Progenetix; CVCL_1725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |