Cellosaurus SW1271 (CVCL_1716)
Cell line name | SW1271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SW-1271; SW 1271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SW1271 (RRID:CVCL_1716) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: RAS genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1031). From: Scott and White Clinic; Temple; USA. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Lung; UBERON=UBERON_0002048. Cell type: Epithelial cell; CL=CL_0000066. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 69Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2177; Cosmic-CLP=1299062; PubMed=25877200; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=1855224 PubMed=17426248; DOI=10.1158/1541-7786.MCR-06-0367 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 PubMed=38180245; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-23-2360; PMCID=PMC11061608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009184
cancercelllines; CVCL_1716 Cell_Model_Passport; SIDM01156 Cosmic-CLP; 1299062 DepMap; ACH-000890 LINCS_LDP; LCL-1824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472877
BioSample; SAMN10987907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | GDSC; 1299062
PharmacoDB; SW1271_1524_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54971075 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2770
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM169452 GEO; GSM170724 GEO; GSM170725 GEO; GSM887665 GEO; GSM888757 GEO; GSM986181 GEO; GSM1670497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 701079
Cosmic; 929966 Cosmic; 932919 Cosmic; 1925844 IARC_TP53; 122 LiGeA; CCLE_662 Progenetix; CVCL_1716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD011896
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |