Cellosaurus SIG-M5 (CVCL_1694)
Cell line name | SIG-M5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SigM5; SIGM5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SIG-M5 (RRID:CVCL_1694) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 50-60 hours (PubMed=10848831); ~72 hours (DSMZ=ACC-468). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone marrow; UBERON=UBERON_0002371. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute myeloid leukemia (NCIt: C9154) Acute myeloid leukemia (ORDO: Orphanet_519) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 63Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=909715; DSMZ=ACC-468; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10848831; DOI=10.1046/j.1365-2141.2000.02013.x PubMed=15843827; DOI=10.1038/sj.leu.2403749 PubMed=16408098; DOI=10.1038/sj.leu.2404081 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-468 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0009016
cancercelllines; CVCL_1694 Cell_Model_Passport; SIDM00396 Cosmic-CLP; 909715 DepMap; ACH-000112 DSMZCellDive; ACC-468 LINCS_LDP; LCL-1071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473111
BioSample; SAMN03473559 BioSample; SAMN10989556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308248
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366251 GDSC; 909715 PharmacoDB; SIGM5_1376_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54953425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887571 GEO; GSM888654 GEO; GSM1374871 GEO; GSM1670421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 787476
Cosmic; 975299 Cosmic; 909715 Cosmic; 1012117 Cosmic; 1281352 Cosmic; 1465968 Cosmic; 2131558 Cosmic; 2306238 Cosmic; 2750871 IARC_TP53; 27574 LiGeA; CCLE_115 Progenetix; CVCL_1694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |