Cellosaurus SCC-3 (CVCL_1683)
Cell line name | SCC-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SCC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SCC-3 (RRID:CVCL_1683) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Population: Japanese. Doubling time: ~2 days (PubMed=3095281). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | B-cell non-Hodgkin lymphoma (NCIt: C3457) B-cell non-Hodgkin lymphoma (ORDO: Orphanet_171915) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 20Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910930; DepMap=ACH-001642; JCRB=JCRB0115; PubMed=25877200 Markers:
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Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3095281; DOI=10.20772/cancersci1985.77.9_862 PubMed=8558920 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | JCRB; JCRB0115 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0037057
cancercelllines; CVCL_1683 Cell_Model_Passport; SIDM00384 Cosmic-CLP; 910930 DepMap; ACH-001642 LINCS_LDP; LCL-1128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03470797
BioSample; SAMN03472740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308215
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366081 GDSC; 910930 PharmacoDB; SCC3_1354_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54952342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827237 GEO; GSM1670410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910930
Cosmic; 998750 Cosmic; 1037667 Cosmic; 1086352 IARC_TP53; 27703 Progenetix; CVCL_1683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |