Cellosaurus RPMI-6666 (CVCL_1665)
Cell line name | RPMI-6666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RPMI 6666; RPMI6666; Roswell Park Memorial Institute 6666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RPMI-6666 (RRID:CVCL_1665) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a Hodgkin lymphoma cell line but is a B-lymphoblastoid cell line (PubMed=12592342; PubMed=20143388; PubMed=29533902). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00263. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=12133989
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 29Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Transformed cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-113; Cosmic-CLP=909701; ECACC=87081807 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=12133989; DOI=10.4049/jimmunol.169.3.1593 PubMed=12592342; DOI=10.1038/sj.leu.2402799 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29533902; DOI=10.1515/hsz-2017-0321 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-113
ECACC; 87081807 KCLB; 10113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008870
Cell_Model_Passport; SIDM00813 Cosmic-CLP; 909701 DepMap; ACH-001182 IGRhCellID; RPMI6666 LINCS_LDP; LCL-2013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151630
BioSample; SAMN03472694 BioSample; SAMN10988187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308884
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366187 GDSC; 909701 PharmacoDB; RPMI6666_1325_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54951196 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002321 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887546 GEO; GSM888629 GEO; GSM1670387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684228
Cosmic; 909701 IARC_TP53; 21291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |