Cellosaurus RPMI-2650 (CVCL_1664)
Cell line name | RPMI-2650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | RPMI 2650; RPMI2650; R.P.M.I. #2650; Roswell Park Memorial Institute 2650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: RPMI-2650 (RRID:CVCL_1664) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: ~40-50 hours (DSMZ=ACC-287). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Misspelling: CCL30; Note=Based on the ATCC catalog number. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=77569
Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Head and neck squamous cell carcinoma (NCIt: C34447) NUT carcinoma (NCIt: C45716) NUT midline carcinoma (ORDO: Orphanet_443167) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-30; CLS=300323; Cosmic-CLP=909700; DepMap=ACH-001385; DSMZ=ACC-287; ECACC=88031602; JCRB=JCRB9058; KCLB=10030; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=14082866 PubMed=5831238; DOI=10.1016/0014-4827(65)90022-4 DOI=10.1007/BF02618370 DOI=10.1007/978-1-4757-1647-4_13 PubMed=174085; DOI=10.1073/pnas.72.12.4971; PMCID=PMC388856 PubMed=1260760 PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=77569; DOI=10.1111/j.1399-0039.1978.tb01259.x PubMed=6277475 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 DOI=10.1016/B978-0-12-333530-2.50007-1 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29348827; DOI=10.18632/oncotarget.22862; PMCID=PMC5762512 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-30
BCRC; 60296 BCRJ; 0412 CLS; 300323 DSMZ; ACC-287 ECACC; 88031602 IZSLER; BS TCL 59 JCRB; JCRB9058 KCLB; 10030 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008869
CLO; CLO_0008876 CLDB; cl4174 CLDB; cl4175 CLDB; cl4176 cancercelllines; CVCL_1664 Cell_Model_Passport; SIDM00809 Cosmic-CLP; 909700 DepMap; ACH-001385 DSMZCellDive; ACC-287 IGRhCellID; RPMI2650%20GSE9585 LINCS_LDP; LCL-1881 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0004205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821660
BioSample; SAMN01821717 BioSample; SAMN03473151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308780
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075566 GDSC; 909700 PharmacoDB; RPMI2650_1324_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54951175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM960607 GEO; GSM960608 GEO; GSM960609 GEO; GSM960610 GEO; GSM960611 GEO; GSM960612 GEO; GSM960613 GEO; GSM1374853 GEO; GSM1374854 GEO; GSM1670386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 686978
Cosmic; 909700 Cosmic; 1006465 Cosmic; 1017789 Cosmic; 1041670 Cosmic; 1339925 Cosmic; 2043886 IARC_TP53; 21290 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |