Cellosaurus OE19 (CVCL_1622)
Cell line name | OE19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | OE-19; JROECL 19; JROECL19; OEC19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: OE19 (RRID:CVCL_1622) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: MD Anderson Cell Lines Project. Part of: TCGA-110-CL cell line panel. Characteristics: Contains a 100 fold amplification of ERBB2 (PubMed=15511476). Doubling time: ~50-60 hours (DSMZ=ACC-700). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Protein expression by reverse-phase protein arrays. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Esophagus; UBERON=UBERON_0001043. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Esophageal adenocarcinoma (NCIt: C4025) Adenocarcinoma of the esophagus (ORDO: Orphanet_99976) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 72Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910079; DSMZ=ACC-700; ECACC=96071721; PubMed=20075370; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://tcpaportal.org/mclp/ https://www.culturecollections.org.uk/products/cell-cultures/ecacc-cell-line-profiles/oe19/ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9010035; DOI=10.1038/bjc.1997.42; PMCID=PMC2063267 PubMed=15511476; DOI=10.1016/j.athoracsur.2004.05.037 PubMed=16364037; DOI=10.1111/j.1442-2050.2006.00530.x PubMed=20075370; DOI=10.1093/jnci/djp499; PMCID=PMC2902814 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=24083764; DOI=10.7314/APJCP.2013.14.8.4891 PubMed=25070024; DOI=10.1007/s00423-014-1235-1 PubMed=23795680; DOI=10.1111/dote.12095 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26512696; DOI=10.3390/cancers7040881; PMCID=PMC4695881 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28196595; DOI=10.1016/j.ccell.2017.01.005; PMCID=PMC5501076 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31395879; DOI=10.1038/s41467-019-11415-2; PMCID=PMC6687785 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-700
ECACC; 96071721 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008238
CLDB; cl3761 cancercelllines; CVCL_1622 Cell_Model_Passport; SIDM00479 Cosmic-CLP; 910079 DepMap; ACH-000679 DSMZCellDive; ACC-700 IGRhCellID; OE19 LINCS_LDP; LCL-1796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471032
BioSample; SAMN10988362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308462
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075555 GDSC; 910079 PharmacoDB; OE19_1194_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54931862 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002308 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827301 GEO; GSM887475 GEO; GSM888555 GEO; GSM1264050 GEO; GSM1264051 GEO; GSM1264052 GEO; GSM1264053 GEO; GSM1264054 GEO; GSM1264092 GEO; GSM1264093 GEO; GSM1264094 GEO; GSM1264095 GEO; GSM1264096 GEO; GSM1670302 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 871232
Cosmic; 910079 Cosmic; 978854 Cosmic; 997860 Cosmic; 1175878 Cosmic; 1599342 Cosmic; 1618819 Cosmic; 1995600 IARC_TP53; 21600 LiGeA; CCLE_923 Progenetix; CVCL_1622 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |