Cellosaurus NCI-H2029 (CVCL_1516)
Cell line name | NCI-H2029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | H2029; H-2029; NCIH2029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: NCI-H2029 (RRID:CVCL_1516) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep proteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: The stock distributed by ATCC seems to have lost the D13S317 allele which is not detectable (ATCC=CRL-5913). Derived from site: Metastatic; Lymph node; UBERON=UBERON_0000029. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Lung small cell carcinoma (NCIt: C4917) Small cell lung cancer (ORDO: Orphanet_70573) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Originate from same individual | CVCL_1513 ! NCI-H1994 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 69Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-5913; Cosmic-CLP=688011; PubMed=20679594 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8806092; DOI=10.1002/jcb.240630505 PubMed=8806103; DOI=10.1002/jcb.240630516 PubMed=11030152; DOI=10.1038/sj.onc.1203815 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20679594; DOI=10.1093/jnci/djq279; PMCID=PMC2935474 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31803961; DOI=10.1002/jcb.29564; PMCID=PMC7496084 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-5913 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008040
cancercelllines; CVCL_1516 Cell_Model_Passport; SIDM00735 Cosmic-CLP; 688011 DepMap; ACH-000298 LINCS_LDP; LCL-1814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005977 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN10987644 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308473
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075529 GDSC; 688011 PharmacoDB; NCIH2029_1057_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54907905 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887396 GEO; GSM888474 GEO; GSM1670207 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688011
Cosmic; 1995552 Cosmic; 2125207 IARC_TP53; 21551 LiGeA; CCLE_738 Progenetix; CVCL_1516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD011896
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |