Cellosaurus SK-N-MC-IXC (CVCL_1398)
Cell line name | SK-N-MC-IXC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | MC-IXC; MCIXC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SK-N-MC-IXC (RRID:CVCL_1398) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Parent cell line (SK-N-MC) was originally thought to be a neuroblastoma cell line but shown to be from an Askin tumor. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. From: Memorial Sloan Kettering Cancer Center; New York; USA. Registration: Memorial Sloan Kettering Cancer Center Office of Technology Development; SK2010-067. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Instable (MSI-low) (Sanger). Omics: Array-based CGH. Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: Metastatic; Orbital region; UBERON=UBERON_0004088. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Askin tumor (NCIt: C7542) Peripheral primitive neuroectodermal tumor (ORDO: Orphanet_370348) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0530 (SK-N-MC) Children:
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Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 12Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2270; Cosmic-CLP=908118; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://www.mskcc.org/research-advantage/support/technology/tangible-material/sk-n-mc-ixc-human-neuroblastoma-cell-line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=4748425 PubMed=15892104; DOI=10.1002/gcc.20198 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2270 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007615
cancercelllines; CVCL_1398 Cell_Model_Passport; SIDM01246 Cosmic-CLP; 908118 DepMap; ACH-002160 IGRhCellID; MCIXC LINCS_LDP; LCL-1967 TOKU-E; 4055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03472918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308758
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075495 GDSC; 908118 PharmacoDB; MCIXC_886_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54954480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 GEO; GSM1670077 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688068
Cosmic; 908118 Progenetix; CVCL_1398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |