Cellosaurus Loucy (CVCL_1380)
Cell line name | Loucy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LOUCY | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Loucy (RRID:CVCL_1380) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: ENCODE project common cell types; tier 3. Population: Caucasian. Doubling time: 36-48 hours (PubMed=2208060); ~60 hours (DSMZ=ACC-394). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: H3K79me1 ChIP-seq epigenome analysis. Omics: H3K9ac ChIP-seq epigenome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C9142) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 38Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-2629; Cosmic-CLP=907789; DSMZ=ACC-394; Technion Genomics Center Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://humantallcelllines.wordpress.com/comprehensivetable/loucy/ http://genome.ucsc.edu/ENCODE/protocols/cell/human/Loucy_Bernstein_protocol.pdf | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=2208060; DOI=10.1016/0165-4608(90)90148-4 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=17170727; DOI=10.1038/sj.leu.2404486 PubMed=19166587; DOI=10.1186/1756-8722-2-3; PMCID=PMC2636835 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-2629
DSMZ; ACC-394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007375
cancercelllines; CVCL_1380 Cell_Model_Passport; SIDM00342 Cosmic-CLP; 907789 DepMap; ACH-000104 DSMZCellDive; ACC-394 LINCS_LDP; LCL-1017 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471756
BioSample; SAMN03473575 BioSample; SAMN10988140 ENCODE; ENCBS080PZG ENCODE; ENCBS170DPY ENCODE; ENCBS708EFA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308208
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366252 GDSC; 907789 PharmacoDB; LOUCY_855_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54902892 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0007112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887272 GEO; GSM888347 GEO; GSM1670053 GEO; GSM2037136 GEO; GSM2037137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907789
Cosmic; 913420 Cosmic; 1115598 Cosmic; 1151784 Cosmic; 1175133 Cosmic; 1330496 Cosmic; 1524802 Cosmic; 1641381 Cosmic; 1664525 Cosmic; 1760527 Cosmic; 2165717 Cosmic; 2588705 Cosmic; 2588710 Cosmic; 2602920 IARC_TP53; 9767 LiGeA; CCLE_359 Progenetix; CVCL_1380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |