Cellosaurus LN-405 (CVCL_1378)
Cell line name | LN-405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | LN 405; LN405 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: LN-405 (RRID:CVCL_1378) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~60 hours (DSMZ=ACC-189). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Brain, left fronto-temporal lobe. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Glioblastoma (NCIt: C3058) Glioblastoma (ORDO: Orphanet_360) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 61Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=910694; DSMZ=ACC-189; PubMed=11416159; PubMed=22570425 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=10416987; DOI=10.1111/j.1750-3639.1999.tb00536.x; PMCID=PMC8098486 PubMed=11416159; DOI=10.1073/pnas.121616198; PMCID=PMC35459 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=21406405; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-10-3112 PubMed=22570425; DOI=10.1093/neuonc/nos072; PMCID=PMC3367844 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-189 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0007364
CLDB; cl3242 cancercelllines; CVCL_1378 Cell_Model_Passport; SIDM00343 Cosmic-CLP; 910694 DepMap; ACH-002268 DSMZCellDive; ACC-189 LINCS_LDP; LCL-1395 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473369 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308756
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075491 GDSC; 910694 PharmacoDB; LN405_845_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54902781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326241 GEO; GSM1670050 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687578
Cosmic; 849868 Cosmic; 910694 Cosmic; 1746949 Cosmic; 2302332 Cosmic; 2367536 Cosmic; 2580914 IARC_TP53; 21474 Progenetix; CVCL_1378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |