Cellosaurus HuTu 80 (CVCL_1301)
Cell line name | HuTu 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HUTU 80; Hutu 80; HuTu-80; HUTU-80; Hutu-80; HUTU80; HuTu80; Hutu80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HuTu 80 (RRID:CVCL_1301) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Doubling time: 26.90 hours (PubMed=25944804); 26 hours (PubMed=25984343); 26-30 hours (CLS=300218). Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=25926053; Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: shRNA library screening. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: According to ATCC the ethnicity of the donor is White, but exome analysis finds it to be mostly of African lineage. Derived from site: In situ; Small intestine, duodenum; UBERON=UBERON_0002114. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Duodenal adenocarcinoma (NCIt: C7889) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 53Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): AddexBio=C0010001/49; ATCC=HTB-40; CCRID=1101HUM-PUMC000141; CLS=300218; Cosmic-CLP=907073; KCLB=30040; PubMed=25926053 Markers:
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Web pages | https://www.thermofisher.com/ch/en/home/technical-resources/cell-lines/h/cell-lines-detail-467.html | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=327080; DOI=10.1093/jnci/59.1.221 PubMed=833871; DOI=10.1093/jnci/58.2.209 PubMed=6256643; DOI=10.1038/288724a0 PubMed=22282976; DOI=10.1093/carcin/1.1.21 PubMed=6220172 PubMed=6825208; DOI=10.1093/carcin/4.2.199 PubMed=6500159; DOI=10.1159/000163283 PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25984343; DOI=10.1038/sdata.2014.35; PMCID=PMC4432652 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=25944804; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-14-2457 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | AddexBio; C0010001/49
ATCC; CRL-7928 - Discontinued ATCC; HTB-40 CLS; 300218 IZSLER; BS TCL 95 KCB; KCB 200721YJ KCLB; 30040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004305
CLO; CLO_0009964 CLDB; cl1780 CLDB; cl5208 cancercelllines; CVCL_1301 CCRID; 1101HUM-PUMC000141 Cell_Model_Passport; SIDM00694 Cosmic-CLP; 907073 DepMap; ACH-000538 LINCS_HMS; 50016 LINCS_LDP; LCL-1150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0005967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471124
BioSample; SAMN10988182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307410
ChEMBL-Targets; CHEMBL614582 GDSC; 907073 PharmacoDB; HUTU80_648_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54896930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0022687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887155 GEO; GSM888227 GEO; GSM1448180 GEO; GSM1669924 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687549
Cosmic; 907073 Cosmic; 1071891 Cosmic; 1176592 Cosmic; 1223144 Cosmic; 2301549 IARC_TP53; 21385 LiGeA; CCLE_186 Progenetix; CVCL_1301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 10-Sep-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |