Cellosaurus HD-MY-Z (CVCL_1273)
Cell line name | HD-MY-Z | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | HD-MyZ; HDMYZ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HD-MY-Z (RRID:CVCL_1273) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a Hodgkin lymphoma cell line, but seems to be an acute myeloid leukemia cell line (PubMed=29533902). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~35 hours (DSMZ=ACC-346). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Adult acute myeloid leukemia (NCIt: C9154) Acute myeloid leukemia (ORDO: Orphanet_519) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 29Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907050; DSMZ=ACC-346 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8386741; DOI=10.1084/jem.177.5.1257; PMCID=PMC2191008 DOI=10.1159/000425254 PubMed=8558920 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=29533902; DOI=10.1515/hsz-2017-0321 PubMed=30285677; DOI=10.1186/s12885-018-4840-5; PMCID=PMC6167786 PubMed=30629668; DOI=10.1371/journal.pone.0210404; PMCID=PMC6328144 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003672
cancercelllines; CVCL_1273 Cell_Model_Passport; SIDM01063 Cosmic-CLP; 907050 DepMap; ACH-000190 DSMZCellDive; ACC-346 IGRhCellID; HDMYZ LINCS_LDP; LCL-2008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473357
BioSample; SAMN10988283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308544
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366322 GDSC; 907050 PharmacoDB; HDMYZ_520_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54882098 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM887065 GEO; GSM888135 GEO; GSM1669871 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907050
Cosmic; 1086356 Cosmic; 1278833 IARC_TP53; 21366 LiGeA; CCLE_625 Progenetix; CVCL_1273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |