Cellosaurus HC-1 (CVCL_1243)
Cell line name | HC-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | HC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: HC-1 (RRID:CVCL_1243) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Possibly misclassified. It is not certain that this cell line originate from a hairy cell leukemia (PubMed=22653958). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: LL-100 blood cancer cell line panel. Population: Caucasian. Doubling time: ~45 hours (DSMZ=ACC-301). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: DSMZCellDive=ACC-301
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Hairy cell leukemia (NCIt: C7402) Classic hairy cell leukemia (ORDO: Orphanet_58017) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 56Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=907044; DSMZ=ACC-301 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1851909 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20454443; DOI=10.1155/2010/904767; PMCID=PMC2861168 PubMed=22653958; DOI=10.1182/blood-2011-12-400374 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31160637; DOI=10.1038/s41598-019-44491-x; PMCID=PMC6547646 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003627
cancercelllines; CVCL_1243 Cell_Model_Passport; SIDM01073 Cosmic-CLP; 907044 DepMap; ACH-002242 DSMZCellDive; ACC-301 LINCS_LDP; LCL-1086 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308522
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366299 GDSC; 907044 PharmacoDB; HC1_444_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54881463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 ArrayExpress; E-MTAB-7721 ArrayExpress; E-MTAB-7722 GEO; GSM1669840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 907044
Cosmic; 1809512 Cosmic; 2690009 IARC_TP53; 21358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 34 |