Cellosaurus GCT (CVCL_1229)
Cell line name | GCT | ||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Giant Cell Tumor | ||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: GCT (RRID:CVCL_1229) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: Tumor Immunology Bank (TIB) collection from Salk (transferred to ATCC in 1981). Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Pleural effusion; UBERON=UBERON_0000175. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Undifferentiated pleomorphic sarcoma (NCIt: C4247) Undifferentiated pleomorphic sarcoma (ORDO: Orphanet_2023) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 29Y | ||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC; CLS; Cosmic-CLP; IZSLER Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=7689482 PubMed=12068308; DOI=10.1038/nature00766 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; TIB-223
BCRC; 60474 CLS; 300155 IZSLER; BS TCL 94 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003464
CLDB; cl1445 cancercelllines; CVCL_1229 Cell_Model_Passport; SIDM00853 Cosmic-CLP; 906999 DepMap; ACH-000835 IGRhCellID; GCT LINCS_LDP; LCL-1752 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471887
BioSample; SAMN10987909 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308471
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075448 GDSC; 906999 PharmacoDB; GCT_401_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835514 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002182 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM184402 GEO; GSM184403 GEO; GSM827496 GEO; GSM887022 GEO; GSM888092 GEO; GSM1669807 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 684227
Cosmic; 906999 IARC_TP53; 21341 LiGeA; CCLE_019 Progenetix; CVCL_1229 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 05-Oct-2023 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |