Cellosaurus G-402 (CVCL_1221)
Cell line name | G-402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | G402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: G-402 (RRID:CVCL_1221) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: 24.4 hours (Note=Lot 062392) (JCRB=JCRB9070). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: This cell line is said to originate from a 'renal leiomyoblastoma'. This is an antiquated/imprecise terminology that can not be assigned to a precise cancer type. As there is no information on the exact origin of this cell line, except that it was deposited by Peebles P.T at ATCC, we have assigned it to the generic 'kidney neoplasm' of NCIt. Derived from site: In situ; Kidney; UBERON=UBERON_0002113. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Kidney neoplasm (NCIt: C3150) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 9M | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1440; Cosmic-CLP=907298; ECACC=90112715; JCRB=JCRB9070; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1440
ECACC; 90112715 IZSLER; BS TCL 212 JCRB; JCRB9070 KCLB; 21440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0003435
CLDB; cl1410 cancercelllines; CVCL_1221 Cell_Model_Passport; SIDM00855 Cosmic-CLP; 907298 DepMap; ACH-000375 IGRhCellID; G402 LINCS_LDP; LCL-1751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0000678 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473165
BioSample; SAMN10988323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308733
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075446 GDSC; 907298 PharmacoDB; G402_375_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54835350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM827166 GEO; GSM887018 GEO; GSM888087 GEO; GSM1669800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687593
Cosmic; 907298 IARC_TP53; 21335 LiGeA; CCLE_658 Progenetix; CVCL_1221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 38 |