Cellosaurus EGI-1 (CVCL_1193)
Cell line name | EGI-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Egi-1; EGI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EGI-1 (RRID:CVCL_1193) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: >45 hours (DSMZ=ACC-385). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bile duct; UBERON=UBERON_0002394. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Cholangiocarcinoma (NCIt: C4436) Cholangiocarcinoma (ORDO: Orphanet_70567) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 52Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=906853; DepMap=ACH-001494; DSMZ=ACC-385 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 CLPUB00275 PubMed=26956050; DOI=10.18632/oncotarget.7914; PMCID=PMC4991440 PubMed=27231123; DOI=10.1158/2159-8290.CD-15-1442; PMCID=PMC5458737 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=32899426; DOI=10.3390/cancers12092510; PMCID=PMC7565451 PubMed=35640676; DOI=10.1016/j.ajpath.2022.05.007; PMCID=PMC9472155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-385 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002895
cancercelllines; CVCL_1193 Cell_Model_Passport; SIDM01050 Cosmic-CLP; 906853 DepMap; ACH-001494 DSMZCellDive; ACC-385 LINCS_LDP; LCL-1787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308731
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075442 GDSC; 906853 PharmacoDB; EGI1_327_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1193 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54832088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 906853
Cosmic; 927186 Cosmic; 1373548 Cosmic; 2674064 IARC_TP53; 21324 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 36 |