Cellosaurus EB3 [Human Burkitt lymphoma] (CVCL_1185)
Cell line name | EB3 [Human Burkitt lymphoma] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | EB-3; Epstein-Barr-3; GM04679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: EB3 [Human Burkitt lymphoma] (RRID:CVCL_1185) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Partially contaminated. Some stocks (such as IFO50028) were contaminated by Daudi. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00380. Population: African; Ugandan. Doubling time: 48 hours (PubMed=5884338). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Transformant: NCBI_TaxID; 10376; Epstein-Barr virus (EBV). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Bone, jaw, maxilla; UBERON=UBERON_0002397. Cell type: B-cell; CL=CL_0000236. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | EBV-related Burkitt lymphoma (NCIt: C27694) Burkitt lymphoma (ORDO: Orphanet_543) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 3Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-85; CCRID=1101HUM-PUMC000343; CLS=300373; Cosmic-CLP=906847; ECACC=90121003; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx https://cellbank.nibiohn.go.jp/legacy/cellbank/qualitycontrol/identification/summary.htm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=5884338 PubMed=4169243; DOI=10.1093/jnci/39.5.1027 PubMed=6018567 PubMed=4894370; DOI=10.1002/1097-0142(196908)24:2<211::AID-CNCR2820240202>3.0.CO;2-3 DOI=10.1007/BF02618370 PubMed=4342611; DOI=10.1136/jcp.25.8.701; PMCID=PMC477481 PubMed=4736620; DOI=10.1111/j.1469-1809.1973.tb00588.x PubMed=7316467; DOI=10.1111/j.1469-1809.1980.tb00953.x PubMed=6286763; DOI=10.4049/jimmunol.129.3.1336 PubMed=2985879; DOI=10.1016/0145-2126(85)90084-0 PubMed=2998993 PubMed=3159941; DOI=10.1016/0145-2126(85)90134-1 PubMed=3874327; DOI=10.1016/0145-2126(85)90133-x PubMed=3518877; DOI=10.3109/07357908609038260 PubMed=2052620; DOI=10.1073/pnas.88.12.5413; PMCID=PMC51883 CLPUB00447 PubMed=8515068; DOI=10.4049/jimmunol.150.12.5418 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-85
CLS; 300373 Coriell; GM04679 ECACC; 90121003 JCRB; IFO50028 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002874
CLO; CLO_0019013 cancercelllines; CVCL_1185 CCRID; 1101HUM-PUMC000343 Cell_Model_Passport; SIDM00793 CGH-DB; 9198-4 Cosmic-CLP; 906847 DepMap; ACH-002236 IGRhCellID; EB3 LINCS_LDP; LCL-2032 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473119 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308824
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366369 GDSC; 906847 PharmacoDB; EB3_312_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54831748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002174 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687840
Cosmic; 906847 Cosmic; 1818343 IARC_TP53; 155 IARC_TP53; 21145 Progenetix; CVCL_1185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 43 |