Cellosaurus ChaGo-K-1 (CVCL_1121)
Cell line name | ChaGo-K-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CHAGO-K-1; ChaGo K-1; ChaGo-K1; CHAGOK1; ChaGoK1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: ChaGo-K-1 (RRID:CVCL_1121) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Hypodermis; UBERON=UBERON_0002072. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Bronchogenic carcinoma (NCIt: C35875) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_DG43 (ChaGo) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 45Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=HTB-168; Cosmic-CLP=687596; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=62839; DOI=10.1093/jnci/56.5.911 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=31978347; DOI=10.1016/j.cell.2019.12.023; PMCID=PMC7339254 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; HTB-168
ECACC; 96020948 IZSLER; BS TCL 186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002413
cancercelllines; CVCL_1121 Cell_Model_Passport; SIDM00924 Cosmic-CLP; 687596 DepMap; ACH-000867 LINCS_LDP; LCL-1579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO_0003108 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473197
BioSample; SAMN10987978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308489
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075421 GDSC; 687596 PharmacoDB; ChaGoK1_196_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54811725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM784215 GEO; GSM827465 GEO; GSM886927 GEO; GSM887993 GEO; GSM1669674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687596
Cosmic; 1995366 IARC_TP53; 21266 LiGeA; CCLE_416 Progenetix; CVCL_1121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 42 |