Cellosaurus CCF-STTG1 (CVCL_1118)
Cell line name | CCF-STTG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | CCFSTTG1; STTG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CCF-STTG1 (RRID:CVCL_1118) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: PTEN genetic alteration cell panel (ATCC TCP-1030). Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Brain; UBERON=UBERON_0000955. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Astrocytoma (NCIt: C60781) Astrocytoma (ORDO: Orphanet_94) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 68Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1718; CLS=300388; Cosmic-CLP=906823; PubMed=25877200; RCB=RCB1977 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=3877740; DOI=10.1016/0165-5728(85)90005-0 PubMed=1404494; DOI=10.1002/jnr.490320212 DOI=10.1007/0-306-46861-1_11 PubMed=19435942; DOI=10.1215/15228517-2009-025; PMCID=PMC2743214 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1718
CLS; 300388 ECACC; 90021502 IZSLER; BS TCL 125 RCB; RCB1977 - Discontinued TKG; TKG 0581 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002329
CLDB; cl669 CLDB; cl5177 cancercelllines; CVCL_1118 Cell_Model_Passport; SIDM00131 Cosmic-CLP; 906823 DepMap; ACH-000329 IGRhCellID; CCFSTTG1 LINCS_LDP; LCL-1394 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003863 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821545
BioSample; SAMN03470976 BioSample; SAMN10988114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308795
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075419 GDSC; 906823 PharmacoDB; CCFSTTG1_188_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM326233 GEO; GSM886923 GEO; GSM887989 GEO; GSM1374443 GEO; GSM1669668 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 687565
Cosmic; 849857 Cosmic; 897441 Cosmic; 906823 Cosmic; 920820 Cosmic; 1175808 Cosmic; 1610750 Cosmic; 1746959 Cosmic; 2302324 Cosmic; 2367511 IARC_TP53; 21217 LiGeA; CCLE_127 Progenetix; CVCL_1118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD003914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 37 |