Cellosaurus CAL-62 (CVCL_1112)
Cell line name | CAL-62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Cal-62; CAL 62; Cal 62; CAL62; Centre Antoine Lacassagne-62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: CAL-62 (RRID:CVCL_1112) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Doubling time: ~24 hours (DSMZ=ACC-448). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Thyroid gland; UBERON=UBERON_0002046. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Thyroid gland anaplastic carcinoma (NCIt: C3878) Anaplastic thyroid carcinoma (ORDO: Orphanet_142) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 70Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=906828; DSMZ=ACC-448; PubMed=18713817; PubMed=25365311; PubMed=30737244 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=1369551 PubMed=18713817; DOI=10.1210/jc.2008-1102; PMCID=PMC2582569 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23833040; DOI=10.1210/jc.2013-2383; PMCID=PMC3763971 PubMed=25365311; DOI=10.1210/jc.2014-2359; PMCID=PMC4318896 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30737244; DOI=10.1158/1078-0432.CCR-18-2953; PMCID=PMC6522280 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | CLS; 305114
DSMZ; ACC-448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002187
cancercelllines; CVCL_1112 CCRID; 3101HUMSCSP546 Cell_Model_Passport; SIDM00931 Cosmic-CLP; 906828 DepMap; ACH-000174 DSMZCellDive; ACC-448 IGRhCellID; CAL62 LINCS_LDP; LCL-1683 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0002146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473548
BioSample; SAMN10988563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308099
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075413 GDSC; 906828 PharmacoDB; CAL62_174_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54808410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM886911 GEO; GSM887977 GEO; GSM1669654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 891257
Cosmic; 906828 Cosmic; 1152118 Cosmic; 1162838 Cosmic; 1239974 Cosmic; 2054116 Cosmic; 2613252 IARC_TP53; 21213 LiGeA; CCLE_550 Progenetix; CVCL_1112 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |