Cellosaurus BFTC-909 (CVCL_1084)
Cell line name | BFTC-909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | BFTC 909; BFTC909; Black Foot disease Transitional Carcinoma 909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BFTC-909 (RRID:CVCL_1084) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Chinese; Taiwan. Doubling time: 49.4 hours (PubMed=8712703); ~50 hours (DSMZ=ACC-367). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Kidney, renal pelvis; UBERON=UBERON_0001224. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Renal pelvis urothelial carcinoma (NCIt: C7355) Upper tract urothelial carcinoma (ORDO: Orphanet_598216) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 64Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): BCRC=60069; Cosmic-CLP=910698; DSMZ=ACC-367; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=8712703 PubMed=11668190; DOI=10.1177/002215540104901105 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=23599788; DOI=10.3892/ol.2013.1140; PMCID=PMC3629091 PubMed=24367658; DOI=10.1371/journal.pone.0084411; PMCID=PMC3867501 PubMed=24035680; DOI=10.1016/j.eururo.2013.08.057 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28489074; DOI=10.1038/ncomms15165; PMCID=PMC5436135 PubMed=29732388; DOI=10.3233/BLC-180167; PMCID=PMC5929350 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | BCRC; 60069
DSMZ; ACC-367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001949
cancercelllines; CVCL_1084 Cell_Model_Passport; SIDM00988 Cosmic-CLP; 910698 DepMap; ACH-000792 DSMZCellDive; ACC-367 LINCS_LDP; LCL-1921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473206
BioSample; SAMN10988547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 508 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308710
ChEMBL-Targets; CHEMBL1075397 GDSC; 910698 PharmacoDB; BFTC909_89_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54796210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-2770 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM886880 GEO; GSM887945 GEO; GSM1669618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 910698
Cosmic; 1046687 Cosmic; 1285114 Cosmic; 1286007 Cosmic; 2050439 Cosmic; 2685940 IARC_TP53; 4367 IARC_TP53; 21183 LiGeA; CCLE_090 Progenetix; CVCL_1084 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 39 |