Cellosaurus BE-13 (CVCL_1081)
Cell line name | BE-13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Be-13; BE13; Be13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_1081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: BE-13 (RRID:CVCL_1081) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Contaminated. Shown to be a Peer derivative (PubMed=12592342; PubMed=20143388). Originally thought to originate from the bone marrow of a 11 year old patient with T-ALL. Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Registration: International Cell Line Authentication Committee, Register of Misidentified Cell Lines; ICLAC-00178. Population: Caucasian. Doubling time: ~40-60 hours (DSMZ=ACC-396). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Peripheral blood; UBERON=UBERON_0000178. Cell type: T-cell; CL=CL_0000084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Childhood T acute lymphoblastic leukemia (NCIt: C7953) Precursor T-cell acute lymphoblastic leukemia (ORDO: Orphanet_99861) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_1913 (Peer) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 4Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): Cosmic-CLP=906763; DSMZ=ACC-396 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Web pages | https://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations_v13_distribution.xlsx | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | CLPUB00700 PubMed=6181032; DOI=10.1016/0198-8859(82)90037-4 PubMed=6331881 PubMed=2144611; DOI=10.1128/mcb.10.10.5502-5509.1990; PMCID=PMC361264 PubMed=1727382 DOI=10.1016/B978-0-12-221970-2.50457-5 PubMed=12592342; DOI=10.1038/sj.leu.2402799 PubMed=15361874; DOI=10.1038/ng1425 PubMed=15472075; DOI=10.1126/science.1102160 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20143388; DOI=10.1002/ijc.25242 PubMed=22675565; DOI=10.1371/journal.pone.0038463; PMCID=PMC3366948 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35354797; DOI=10.1038/s41467-022-29224-5; PMCID=PMC8967900 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | DSMZ; ACC-396 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0001921
cancercelllines; CVCL_1081 Cell_Model_Passport; SIDM01245 Cosmic-CLP; 906763 DepMap; ACH-002216 DSMZCellDive; ACC-396 LINCS_LDP; LCL-1044 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03151896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308184
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366303 GDSC; 906763 PharmacoDB; BE13_84_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_1081 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54795852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM1669613 GEO; GSM5137751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 906763
Cosmic; 1115589 Cosmic; 1151773 Cosmic; 1330495 Cosmic; 1760518 Cosmic; 2165705 Cosmic; 2602909 IARC_TP53; 21650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD023662
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 41 |