Cellosaurus Hs 839.T (CVCL_0941)
Cell line name | Hs 839.T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Hs-839-T; Hs839.T; Hs839T; HS839T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Hs 839.T (RRID:CVCL_0941) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a melanoma cell line but using a variety of omics methods was shown to be a a fibroblastic cell line (DOI=10.1101/166199; DepMap=ACH-000180). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Skin; UBERON=UBERON_0002097. Cell type: Fibroblast of skin; CL=CL_0002620. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 42Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Undefined cell line type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-7572; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 DOI=10.1101/166199 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-7572 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004148
cancercelllines; CVCL_0941 Cell_Model_Passport; SIDM01724 DepMap; ACH-000180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473235
BioSample; SAMN10988128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; Hs839_T_601_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54896106 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM827184 GEO; GSM887121 GEO; GSM888192 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | IARC_TP53; 28283
LiGeA; CCLE_266 Progenetix; CVCL_0941 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001002554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |