Cellosaurus Hs 675.T (CVCL_0836)
Cell line name | Hs 675.T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | Hs-675-T; Hs675T; HS675T; Hs675; 675T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0836 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: Hs 675.T (RRID:CVCL_0836) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Problematic cell line: Misclassified. Originally thought to be a colorectal carcinoma cell line but using a variety of omics methods was shown to be a a fibroblastic cell line (DOI=10.1101/166199; DepMap=ACH-000214). Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Naval Biosciences Laboratory (NBL) collection (transferred to ATCC in 1982). Population: Caucasian. Doubling time: 6-7 days (PubMed=176412). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: In situ; Colon; UBERON=UBERON_0001155. Cell type: Fibroblast; CL=CL_0000057. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | Age unspecified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Undefined cell line type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-7400; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=176412; DOI=10.1093/jnci/56.4.843 PubMed=283258; DOI=10.1093/jnci/62.2.225 PubMed=761205 PubMed=22282976; DOI=10.1093/carcin/1.1.21 PubMed=22460905; DOI=10.1038/nature11003; PMCID=PMC3320027 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 DOI=10.1101/166199 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=31068700; DOI=10.1038/s41586-019-1186-3; PMCID=PMC6697103 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-7400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0004038
cancercelllines; CVCL_0836 Cell_Model_Passport; SIDM01564 ColonAtlas; Hs%20675.T DepMap; ACH-000214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03471493
BioSample; SAMN03473156 BioSample; SAMN10988123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | PharmacoDB; Hs675_T_583_2019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54895856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006587 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
ArrayExpress; E-MTAB-2770 GEO; GSM887105 GEO; GSM888176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | IARC_TP53; 30055
LiGeA; CCLE_230 Progenetix; CVCL_0836 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 28 |