Cellosaurus PA-1 (CVCL_0479)
Cell line name | PA-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Synonyms | PA1; PA I; PAI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: PA-1 (RRID:CVCL_0479) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Part of: KuDOS 95 cell line panel. Doubling time: 36 hours (PubMed=2653399); ~24 hours (Note=Lot 01212002) (JCRB=JCRB9061); 22.77 hours (JWGray panel). Microsatellite instability: Stable (MSS) (Sanger). Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Caution: TP53 mutation indicated to be at p.Asn239Asp (c.715A>G) in DOI=10.11418/jtca1981.16.3_173 and PubMed=9359923. Derived from site: Metastatic; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HLA typing | Source: PubMed=26589293
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease | Ovarian mixed germ cell tumor (NCIt: C8114) Mixed germ cell tumor (ORDO: Orphanet_180234) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 12Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CRL-1572; CCRID=1101HUM-PUMC000021; CLS=300402; COG; Cosmic-CLP=909255; DepMap=ACH-001374; ECACC=90013101; JCRB=JCRB9061; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=6931103; DOI=10.1002/ijc.2910250104 PubMed=6740333; DOI=10.1126/science.6740333 PubMed=2653399; DOI=10.1038/bjc.1989.108; PMCID=PMC2247140 DOI=10.11418/jtca1981.16.3_173 PubMed=9290701; DOI=10.1002/(SICI)1098-2744(199708)19:4<243::AID-MC5>3.0.CO;2-D PubMed=9359923; DOI=10.18926/AMO/30789 PubMed=9698466; DOI=10.1006/gyno.1998.5039 PubMed=10567668; DOI=10.3892/ijmm.4.6.597 PubMed=11314036; DOI=10.1038/sj.onc.1204211 PubMed=11330945; DOI=10.1006/gyno.2001.6132 PubMed=15677628; DOI=10.1093/carcin/bgi032 PubMed=16080959; DOI=10.1016/j.cancergencyto.2005.01.003 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=22710073; DOI=10.1016/j.ygyno.2012.06.017; PMCID=PMC3432677 PubMed=23415752; DOI=10.1016/j.molonc.2012.12.007; PMCID=PMC4106023 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CRL-1572
BCRC; 60063 CLS; 300402 ECACC; 90013101 ICLC; HTL97002 IZSLER; BS TCL 179 JCRB; JCRB9061 RCB; RCB1946 - Discontinued TKG; TKG 0573 - Discontinued | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0008350
MCCL; MCC:0000377 CLDB; cl3856 CLDB; cl3857 CLDB; cl3858 CLDB; cl3859 cancercelllines; CVCL_0479 CCRID; 1101HUM-PUMC000021 Cell_Model_Passport; SIDM01140 CGH-DB; 9358-4 Cosmic-CLP; 909255 DepMap; ACH-001374 LINCS_LDP; LCL-1416 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0001591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN01821586
BioSample; SAMN03473209 BioSample; SAMN03472415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308812
ChEMBL-Targets; CHEMBL614949 GDSC; 909255 PharmacoDB; PA1_1235_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54937331 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-783
ArrayExpress; E-MTAB-2706 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM186444 GEO; GSM186445 GEO; GSM784566 GEO; GSM1374804 GEO; GSM1670330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 688112
Cosmic; 801353 Cosmic; 809111 Cosmic; 844343 Cosmic; 909255 Cosmic; 931368 Cosmic; 1093560 Cosmic; 1305331 Cosmic; 1995610 IARC_TP53; 1418 IARC_TP53; 8338 Progenetix; CVCL_0479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610
EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 45 |