Cellosaurus COLO 320HSR (CVCL_0220)
Cell line name | COLO 320HSR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | COLO-320HSR; COLO #320HSR COLO320HSR; COLO 320 HSR; COLO-320-HSR; COLO 320 (HSR); COLO-HSR; Colorado 320 Homogeneously Staining Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: COLO 320HSR (RRID:CVCL_0220) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: COSMIC cell lines project. Population: Caucasian. Microsatellite instability: Stable (MSS) (PubMed=25926053; Sanger). Omics: CRISPR phenotypic screen. Omics: Deep exome analysis. Omics: Deep quantitative phosphoproteome analysis. Omics: Deep quantitative proteome analysis. Omics: DNA methylation analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Derived from site: In situ; Colon, sigmoid; UBERON=UBERON_0001159. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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Genome ancestry | Source: PubMed=30894373
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Disease | Colon adenocarcinoma (NCIt: C4349) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Parent: CVCL_0219 (COLO 320DM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sex of cell | Female | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 55Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): ATCC=CCL-220.1; Cosmic-CLP=910569; KCLB=10220.1; PubMed=25877200; PubMed=25926053 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=498117 PubMed=3164477; DOI=10.1073/pnas.85.13.4804; PMCID=PMC280524 PubMed=20164919; DOI=10.1038/nature08768; PMCID=PMC3145113 PubMed=20215515; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-09-3458; PMCID=PMC2881662 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=25926053; DOI=10.1038/ncomms8002 PubMed=27397505; DOI=10.1016/j.cell.2016.06.017; PMCID=PMC4967469 PubMed=28854368; DOI=10.1016/j.celrep.2017.08.010; PMCID=PMC5583477 PubMed=29444439; DOI=10.1016/j.celrep.2018.01.051; PMCID=PMC6343826 PubMed=30894373; DOI=10.1158/0008-5472.CAN-18-2747; PMCID=PMC6445675 PubMed=30971826; DOI=10.1038/s41586-019-1103-9 PubMed=35839778; DOI=10.1016/j.ccell.2022.06.010; PMCID=PMC9387775 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | ATCC; CCL-220.1
BCRC; 60109 ECACC; 87101501 KCLB; 10220.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | CLO; CLO_0002547
CLO; CLO_0009960 MCCL; MCC:0000109 CLDB; cl832 CLDB; cl833 cancercelllines; CVCL_0220 Cell_Model_Passport; SIDM00842 ColonAtlas; COLO320HSR Cosmic-CLP; 910569 DepMap; ACH-002219 IGRhCellID; COLO320HSR LINCS_LDP; LCL-1189 TOKU-E; 986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRISP screens repositories | BioGRID_ORCS_Cell_line; 847 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3308337
ChEMBL-Targets; CHEMBL2366265 GDSC; 910569 PharmacoDB; COLO320HSR_223_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54814091 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0002137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-38
ArrayExpress; E-MTAB-783 ArrayExpress; E-MTAB-3610 GEO; GSM206462 GEO; GSM274778 GEO; GSM784008 GEO; GSM843491 GEO; GSM1448182 GEO; GSM1669685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 720341
Cosmic; 808508 Cosmic; 910569 Cosmic; 1609506 Cosmic; 1995369 IARC_TP53; 21232 Progenetix; CVCL_0220 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | PRIDE; PXD005235
PRIDE; PXD030304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000978 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 19-Dec-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 40 |