Cellosaurus SNU-638 (CVCL_0102)
Cell line name | SNU-638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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Synonyms | SNU638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession | CVCL_0102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Resource Identification Initiative | To cite this cell line use: SNU-638 (RRID:CVCL_0102) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | Part of: Cancer Dependency Map project (DepMap) (includes Cancer Cell Line Encyclopedia - CCLE). Part of: Seoul National University (SNU) cell line collection. Population: Korean. Doubling time: 25 hours (PubMed=29435981). Omics: Deep exome analysis. Omics: SNP array analysis. Omics: Transcriptome analysis by microarray. Omics: Transcriptome analysis by RNAseq. Derived from site: Metastatic; Ascites; UBERON=UBERON_0007795. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence variations |
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HLA typing | Source: PubMed=25960936
Source: PubMed=26589293
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Disease | Gastric adenocarcinoma (NCIt: C4004) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Species of origin | Homo sapiens (Human) (NCBI Taxonomy: 9606) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Hierarchy | Children:
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Sex of cell | Male | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Age at sampling | 48Y | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | Cancer cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
STR profile | Source(s): DepMap=ACH-001664; KCLB=00638; PubMed=25877200 Markers:
Run an STR similarity search on this cell line | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Publications | PubMed=9033653; DOI=10.1002/(SICI)1097-0215(19970207)70:4<443::AID-IJC12>3.0.CO;2-G PubMed=10812166; DOI=10.1016/S0165-4608(99)00217-4 PubMed=10974411; DOI=10.1016/S0304-3835(00)00535-8 PubMed=15723654; DOI=10.1111/j.1349-7006.2005.00016.x; PMCID=PMC11160020 PubMed=19956504; DOI=10.4143/crt.2005.37.1.1; PMCID=PMC2785416 PubMed=24807215; DOI=10.1038/ncomms4830; PMCID=PMC4024760 PubMed=25960936; DOI=10.4161/21624011.2014.954893; PMCID=PMC4355981 PubMed=25485619; DOI=10.1038/nbt.3080 PubMed=25877200; DOI=10.1038/nature14397 PubMed=26589293; DOI=10.1186/s13073-015-0240-5; PMCID=PMC4653878 PubMed=29435981; DOI=10.1002/ijc.31304 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-references | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line collections (Providers) | KCLB; 00638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Cell line databases/resources | cancercelllines; CVCL_0102
Cell_Model_Passport; SIDM01769 CGH-DB; 127-1 CGH-DB; 9015-4 DepMap; ACH-001664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Anatomy/cell type resources | BTO; BTO:0003478 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological sample resources | BioSample; SAMN03473180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemistry resources | ChEMBL-Cells; CHEMBL3307747
ChEMBL-Targets; CHEMBL614935 PharmacoDB; SNU638_1476_2019 PubChem_Cell_line; CVCL_0102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Encyclopedic resources | Wikidata; Q54955236 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental variables resources | EFO; EFO_0006758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | ArrayExpress; E-MTAB-2706
GEO; GSM1374896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism and mutation databases | Cosmic; 685583
Cosmic; 848143 Cosmic; 869511 Cosmic; 921601 Cosmic; 1067207 Cosmic; 1090457 Cosmic; 1294961 Cosmic; 1528878 Cosmic; 2036662 Cosmic; 2373753 Cosmic; 2484959 Cosmic; 2646587 Cosmic; 2807650 IARC_TP53; 7421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence databases | EGA; EGAS00001000610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry history | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry creation | 04-Apr-2012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last entry update | 02-May-2024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Version number | 35 |